遗体接运工一定要认真做好卫生防护，必要时，还要实施规定期限的隔离。遗体接运工在工作前，应当认真洗手，依次戴工作帽、防护口罩、穿防护服或者长袖工作服。手部皮肤有破损或者疑似有损伤的应当戴乳胶手套。遗体接运人员将遗体接运好后，应当按程序脱卸防护物品，避免洁污交叉，增加污染的机会。脱卸防护物品时，应当用手触及物品的清洁面。
遗体接运工使用的一次性防护服应当符合中华人民共和国国家标准，使用的防护口罩应当是符合中华人民共和国国家标准的一次性拱形医用防护口罩或者符合N95.FFP2标准的防护口罩。防护口罩可连续使用6-8小时。严格按照规程进行手的清洁和消毒。接触非典遗体必须戴上手套，处置结束后，应立即更换手套并进行手的清洁和消毒。
上海市益善殡仪馆曾经作为上海市唯一一家处理非典死亡遗体的殡仪馆，在非典死亡遗体接运的整个过程中制订了一系列的程序和防护措施。
①遗体处理人员操作前先穿好一次性内裤、工作服，再穿好两套封闭式隔离服，戴好防护眼镜、口罩、鞋套和帽子，并每人携带一套防护眼镜、口罩、鞋套、帽子备用。手套先戴医用乳胶手套，外面再戴上白色棉纱手套，以防乳胶手套不慎划破。
②将遗体装车后，遗体处理人员脱下第一套隔离服和佩戴防护用品，装入密封塑料袋内，并洒入消毒液。驾车时戴上备用口罩、手套等防护用品。
③遗体运回殡仪馆后，将遗体卸下，直接送到指定的火化炉火化。
④遗体处理人员在火化炉前脱下第二套隔离衣及防护眼镜、口罩、鞋套、帽子等防护用品。
⑤将两次接触遗体的废弃物(隔离衣、口罩、手套、鞋套、眼镜等防护用品)随遗体进行火化。
⑥遗体处理完毕后，双手立即在事先准备好的0.5%过氧乙酸中浸泡10分钟，用84消毒液洗手，再用药水肥皂搓洗，并用流动清水冲净，洗手水经污水处理后排放，然后用酒精棉花擦拭双手。
⑦洗手完毕，到淋浴间脱去全身衣服，用药水肥皂擦洗全身，进行淋浴冲洗。浴后换上干净衣服，到指定留观隔离室休息。