殡仪馆和火葬场作为公共场所和非典遗体处理点，在卫生消毒方面有更高的要求。卫生部发布通告《公共场所预防传染性非典型肺炎消毒指导原则》，具体规定为:
①非流行区的公共场所是安全的，平时注意加强通风，保持好环境卫生即可，一般不需专门进行消毒。
②流行区的公共场所除加强通风，保持好环境卫生外，需对重点部位以及人员活动频繁的室内地面消毒。
③能正常通风处、室外地面以及车厢等交通工具外部不需消毒。
④消毒的重点部位是:电梯间、卫生间及公众经常接触、使用的器具，包括:柜台、桌椅、沙发、门把手、水龙头、公用电话、电梯开关、公厕、交通工具内部等。
⑤流行区一般每日消毒一次，人员流动频繁的地方适当增加。
大多数消毒药品均有腐蚀性和刺激性，消毒次数过多、消毒液浓度过大，会对人体和环境造成损害。
⑦不同物体有不同的消毒方式，不同的消毒产品有不同的使用方法，要根据消毒对象科学合理地选择和使用。
⑧非典型肺炎病人污染过的场所由专业队伍消毒。
作为公共场所的殡仪馆和火葬场，即使没有接受非典型肺炎死亡遗体的处理，也应该按照上述相应要求进行消毒。